La chiesa, nata con il contributo dei fedeli della “Porta di Sotto” (abitato a sud della Città) voleva esorcizzare le tragiche conseguenze della peste. Ancora oggi esiste una porta laterale che da sul quartiere del “Sanado” un tempo sede dell’Ufficio della Sanità di Borgomanero.
L’erezione del campanile avvenne nel 1665 e la chiesa venne ampliata nel 1683.
Nell’oratorio si conserva la statua del Cristo morto che viene trasportata dai fedeli, per le vie di Borgomanero, durante il “Venerdì Santo” e rievoca i momenti della passione di Nostro Signore.